Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms