Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms