Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM227BQ96M60 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms