Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCZQ96LD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms