Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms