Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG1Q96JA1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms