Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms