Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NXNL1Q96CM4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms