Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RABGGTAQ92696 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RABGGTAQ92696 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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