Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms