Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms