Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms