Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms