Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC191Q8NCU4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms