Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC63Q8NA47 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms