Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms