Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms