Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDPD3Q7L5L3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms