Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms