Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms