Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZRN4Q6ZMN7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms