Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRSAM1Q6UWE0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms