Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A10Q6U841 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms