Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms