Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms