Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms