Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCSD1Q6JBY9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms