Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABLIM2Q6H8Q1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABLIM2Q6H8Q1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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