Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms