Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BROXQ5VW32 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms