Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms