Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPRC1Q5VV67 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPRC1Q5VV67 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPRC1Q5VV67 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPRC1Q5VV67 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPRC1Q5VV67 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms