Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFCAB2Q5VUJ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms