Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT6Q5T7P8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms