Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms