Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms