Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKDCCQ504Y2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms