Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPROQ16827 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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