Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RTN1Q16799 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RTN1Q16799 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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