Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME3Q16798 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ME3Q16798 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ME3Q16798 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME3Q16798 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME3Q16798 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME3Q16798 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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