Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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