Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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