Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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SGCBQ16585 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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