Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GRIK4Q16099 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GRIK4Q16099 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK4Q16099 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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