Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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VAMP3Q15836 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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VAMP3Q15836 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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VAMP3Q15836 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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VAMP3Q15836 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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VAMP3Q15836 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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