Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TWIST1Q15672 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms