Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP10Q15642 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP10Q15642 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms