Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms