Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF13Q15543 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms