Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TLR1Q15399 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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